Las líneas de investigación se seleccionan de acuerdo con la tradición de investigación del Laboratorio Geolóxico de Laxe y con la trayectoria profesional de los miembros del Instituto. En el momento actual se están desarrollando distintas líneas:

Geomorfología y Geología del Cuaternario.

Paleontología del Cuaternario.

Geocronología del Cenozoico.

Arqueología del Próximo Oriente y mundo Mediterráneo.

Intervenciones patrimoniales.

Ordenación del territorio.

Planificación del paisaje.

SIG (Sistemas de Información Geográfica).

Modelos hidrológicos, de flujo y transporte de contaminantes.

Agricultura de precisión.

Espeleología y Pseudo-karst.