As liñas de investigación selecciónanse dacordo coa tradición de investigación do Laboratorio Xeolóxico de Laxe e coa traxectoria profesional dos membros do Instituto. No momento actual estanse a desenvolver distintas liñas:

Xeomorfoloxía e Xeoloxía do Cuaternario.

Paleontoloxía do Cuaternario.

Xeocronoloxía do Cenozoico.

Arqueoloxía do próximo oriente e mundo mediterráneo.

Intervencións patrimoniais.

Ordeación do territorio.

Comunicación do Patrimonio.

Paleoxenética.

Modelos hidrolóxicos, de fluxo e transporte de contaminantes.

Agricultura de precisión.

Espeleoloxía e Pseudo-karst.